Центральное апноэ сна происходит из-за того, что мозг не посылает правильные сигналы мышцам, которые контролируют дыхание . Это состояние отличается от обструктивного апноэ сна, при котором дыхание останавливается из-за того, что мышцы горла расслабляются и блокируют дыхательные пути. Центральное апноэ сна встречается реже, чем обструктивное апноэ сна.