Физиологическая причина - это состояние сонного паралича, которое наступает, когда человек спит. Видимо во сне вы действительно пытаетесь бежать (двигаете ногами, как при беге), а не просто видите сон, что бежите, но ваши мышцы ослаблены сонным параличом, поэтому возникает ощущение, что бежать тяжело.