Экстракты горькой дыни обычно хорошо переносятся, но побочные эффекты могут включать дискомфорт в животе, изжогу, запор или диарею, тошноту и рвоту, головокружение, головную боль и гипогликемию . Редкие, но потенциально серьезные побочные эффекты включают тяжелую гипогликемию, кому и судороги.